У відповідях на запитання про те, на яку глибину необхідно вводити зонд, щоб отримати мазок з носоглотки при здачі ПЛР-тесту на COVID-19, більшість експертів рекомендували проходити ним на кілька сантиметрів вище за ніздрі дорослої людини до тих пір, поки інструмент не зустріне опір. Робити це потрібно обережно та під правильним кутом.

Загалом експерти схильні погоджуватися з тим, що найглибший мазок є найточнішим. Опитування було влаштовано газетою The New York Times у відповідь на численні прохання читачів, які дивувалися, чому різні фахівці по-різному підходять до цього завдання. Хтось лише обережно торкається передньої частини ніздрів, а хтось протискує зонд у глибину, приносячи пацієнту чималі страждання.
Мазки беруться як з ротової порожнини, так і носоглотки, оскільки вхідними воротами для вірусу SARS-CoV-2 є верхні дихальні шляхи. Для дослідження мазок беруть з поверхні мигдаликів, піднебінних дужок і задньої стінки ротоглотки. При взятті мазка з носоглотки зонд за правилами вводять по зовнішній стінці носового ходу на досить велику глибину. Мазок, взятий зі слизової оболонки присінка носа, може не виявити РНК коронавірусу SARS-CoV-2. Особливо сильно при взятті подібних мазків страждають жінки та діти. Хтось зізнається, що не хоче більше повторювати цей досвід. Іноді взяття мазка закінчується сильною кровотечею з носа.
Згідно з оглядом досліджень, опублікованим у липні в науковому журналі PLOS One, мазки з носоглотки мають точність 98%; а неглибокі мазки мають знижену ефективність – від 82 до 88%. Мазки із середньої носової раковини працюють аналогічним чином.
Експерти зазначають також, що болючість процедури може залежати від кваліфікації медперсоналу та від індивідуальних особливостей пацієнта — вона може виглядати досить болісною, а може пройти без жодної шкоди. Проте саме носоглотковий тест найточніший, тому у рекомендаціях ВООЗ та медичних закладів різних країн зазначається, що зонд необхідно ввести на досить велику глибину. Деякі рекомендації, втім, залишають тестерам достатню свободу дій у тому, як саме шкрябати носоглотку — похитуючи або обертаючи тампон, або й те й інше одночасно. Багато чого ще залежить від марки тампона, переносимості болю пацієнтом, анатомічної структури його носової порожнини і кваліфікації тестувальника.